بر اساس نامه ابلاغی سازمان حفاظت محیط زیست، شرح وظایف واحد پژوهش به شرح ذیل می باشد:
- نیازسنجی و تعیین اولویتهای مطالعاتی و پژوهشی در حوزه محیط زیست با توجه به ضرورتها و نیازهای استانی و همکاری معاونت های تخصصی و تلاش در زمینه تصویب طرح ها و پروژه های مطالعاتی و پژوهشی در سطح استان و سازمان.
- انتشار نتایج و دستاوردهای طرح ها و پروژه های پژوهشی- گزارش سالانه محیط زیست استان.
- تشویق و حمایت از از محققان و فعالان عرضه حفاظت از محیط زیست استان (جایزه ملی محیط زیست).
- همکاری با ستاد در بهره گیری از فناوری های نوین محیط زیست و بکارگیری آن در مدیریت منابع و حفاظت.
- تشکیل هسته مشورتی و علمی- پژوهشی با همکاری دانشگاهها و مراکز پژوهشی استان.
- تشکیل بانک اطلاعات پژوهشی استان